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調(diào)節(jié)衰老聚糖時(shí)鐘的基因網(wǎng)絡(luò)圖譜

發(fā)布時(shí)間:2024-01-04 17:26:17來(lái)源:

一篇新的研究論文發(fā)表在《Aging》(被 MEDLINE/PubMed 列為“Aging (Albany NY)”和 Web of Science 的“Aging-US”)第15 卷第 24 期,標(biāo)題為: “繪制調(diào)節(jié)衰老聚糖時(shí)鐘的基因網(wǎng)絡(luò)。”

聚糖是免疫球蛋白 G (IgG) 的重要結(jié)構(gòu)成分,可調(diào)節(jié)其結(jié)構(gòu)和功能。然而,這種復(fù)雜的翻譯后修飾背后的調(diào)控機(jī)制尚不清楚。之前的全基因組關(guān)聯(lián)研究 (GWAS) 鑒定了 29 個(gè)參與 IgG 糖基化調(diào)節(jié)的基因組區(qū)域,但只有少數(shù)得到了功能驗(yàn)證。IgG 糖基化的關(guān)鍵功能特征之一是添加半乳糖(半乳糖基化),這一特征已被證明與衰老相關(guān)。

在這項(xiàng)新研究中,研究人員Azra Frkatovi?-Hod?i?、Anika Mijakovac、Karlo Miškec、Arina Nostaeva、Sodbo Z. Sharapov、Arianna Landini、Toomas Haller、Erik van den Akker、Sapna Sharma、Rafael RC Cua??drat、Massimo Mangino、Yong Li、Toma凱瑟、納吉達(dá)·魯?shù)侣?、塔瑪?middot;斯塔姆布克、瑪雅·普契奇-巴科維奇、伊雷娜·特爾博耶維奇-阿克馬契奇、伊萬(wàn)·古德?tīng)柤⒁?middot;斯塔姆布克、蒂亞·普里比奇、芭芭拉·拉多瓦尼、佩特拉·托米納克、克里斯塔·費(fèi)舍爾、瑪麗安·比克曼、曼弗雷德·伍爾、克里斯蒂安·吉格、馬蒂亞斯·B·舒爾茨、來(lái)自 Genos 糖科學(xué)研究實(shí)驗(yàn)室的 Clemens Wittenbecher、Ozren Polasek、Caroline Hayward、James F. Wilson、Tim D. Spector、Anna Köttgen、Frano Vu?kovi?、Yurii S. Aulchenko、Aleksandar Vojta、Jasminka Krišti?、Lucija Klari?、Vlatka Zoldoš 和 Gordan Lauc (來(lái)自Genos 糖科學(xué)研究實(shí)驗(yàn)室) ,薩格勒布大學(xué),新西伯利亞國(guó)立大學(xué),莫斯科國(guó)立羅蒙諾索夫大學(xué),愛(ài)丁堡大學(xué), 塔爾圖大學(xué),萊頓大學(xué)醫(yī)學(xué)中心,代爾夫特理工大學(xué),慕尼黑亥姆霍茲中心,德國(guó)糖尿病研究中心 (DZD) ,倫敦國(guó)王學(xué)院,蓋伊大學(xué)和圣托馬斯基金會(huì)信托基金、弗萊堡大學(xué)、里耶卡大學(xué)、德國(guó)人類(lèi)營(yíng)養(yǎng)研究所波茨坦-雷布呂克、波茨坦大學(xué)、哈佛大學(xué)陳曾熙公共衛(wèi)生學(xué)院、查爾姆斯理工大學(xué)、斯普利特大學(xué)醫(yī)學(xué)院、代數(shù)大學(xué)學(xué)院、約翰·霍普金斯大學(xué)彭博公共衛(wèi)生學(xué)院和SB RAS 細(xì)胞學(xué)與遺傳學(xué)研究所對(duì) IgG 半乳糖基化 (N=13,705) 進(jìn)行了 GWAS,并鑒定了 16 個(gè)顯著相關(guān)的位點(diǎn),表明 IgG 半乳糖基化受到復(fù)雜的基因網(wǎng)絡(luò)的調(diào)節(jié),該網(wǎng)絡(luò)超出了將半乳糖添加到 IgG 聚糖上的半乳糖基轉(zhuǎn)移酶。

“在這里,我們?cè)谝豁?xiàng)研究中進(jìn)行了 IgG 半乳糖基化表型的 GWAS,與之前的 IgG N-糖基化 GWAS 相比,樣本量幾乎增加了一倍 (N=13,705) [ 33 ],并重點(diǎn)關(guān)注具有計(jì)算機(jī)模擬證據(jù)的基因參與IgG 半乳糖基化過(guò)程。”

基因優(yōu)先排序確定了 37 個(gè)候選基因。利用最近開(kāi)發(fā)的 CRISPR/dCas9 系統(tǒng),研究人員操縱了體外IgG 表達(dá)系統(tǒng)中候選基因的基因表達(dá)。EEF1A1、MANBA 和 TNFRSF13B 三個(gè)基因的上調(diào)改變了 IgG 糖組的組成,這證實(shí)了這三個(gè)基因參與了該體外表達(dá)系統(tǒng)中的 IgG 半乳糖基化。

“需要進(jìn)一步的研究來(lái)充分闡明它們?cè)谒ダ现械淖饔帽澈蟮墓δ軝C(jī)制,并揭示調(diào)節(jié) IgG 糖基化復(fù)雜過(guò)程的基因相互作用的完整網(wǎng)絡(luò)。”

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